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苗医药也是祖国医学的重要组成部分，她的历史甚至比中医药的还要悠久，民间有“千年苗医，万年苗药”一说。在长期的医疗实践中，苗医药逐渐形成了两纲、五经、三十六症、七十二疾，即纲、经、症、疾的医理模式。对慢性疼痛的治疗方面，苗医药拥有疗效突出、别具特色的治疗方法及药物。苗族医药在我省城乡人民中享有盛名，苗医不但能治常见病、多发病，也治好了不少疑难怪症，彰显着苗医药无穷魅力和神秘气息，其神奇的疗效更是让现代医学感叹。
该院的苗医学科，是集临床、教学、科研为一体的综合性专科，是中医针灸治疗方法和贵州苗医药治疗方法特点的优化组合而福泽大众。经过6年的建设，从创建之初的3人，1间诊室到现在6人（正好职称1人，副好职称2人，中级职称1人，硕士生导师2人），年门诊量达到万余人次，拥有病床20余张。
我学科现承担贵阳中医学院本科、硕士研究生的培养。学科主持省厅级课题11项，其中国家级2项，省部级1项，学科共获得省级以上科技进步奖 1项，成果 1 项。
学科治疗重点涉及以下几类常见疾病：
一、神经系统疾病：三叉神经痛、面瘫、坐骨神经痛、头痛、眩晕、中风偏瘫、失语、痴呆、失眠 、脑外伤和脑手术后、脊髓损伤、多发性硬化、痴呆症、帕金森病等的康复治疗；
二、运动系统疾病: 颈椎病、肩周炎、急性腰扭伤、腰椎间盘突出症、关节炎 、骨质疏松、外伤性损伤、关节置换术后等的康复治疗（尤其是骨科手术后膝关节僵硬和腱鞘炎若在我科行针刀康复治疗，疗效90%以上）；
三、内科、妇科、儿科疾病: 支气管炎、哮喘、消化性炎症、呃逆、糖尿病、脂肪肝、痛经、脑性瘫痪，内分泌紊乱等；
四、慢性前列腺炎、近视、牙痛、黄褐斑、肥胖症、戒烟等。采用独特的弩药针疗法、角罐法、隔药纸火疗法、刮痧疗法、苗药熏蒸疗法、玉杵点穴疗法、针刺、灸法、针刀、穴位埋线、走罐法等康复治疗手段，为患者解除痛苦，大限度地恢复功能。
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