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公共卫生学院非常重视科研，将其视为增加教师业务水平和促进教学的重要途径。科研，教师们能够了解本学科的新进展，将其融合到教学实践中。同时，使在校学生有机会参与到科学实践中，增加了学生培养质量。
近五年来，公共卫生学院承担科研课题和项目共68项，其中国家自然科学基金4项，国际合作项目9项，国家十五攻关课题1项，其他省、部基金30项。近五年教职员工在各类期刊上发表论文219篇，其中SCI收录4篇；出版专著15部，参编教材12部，获发明专利2项，云南省科学技术进步三等奖5项。近5年来，公共卫生学院申请到科研/项目资金共1,005万元人民币。其中来自国家一级资助的有538万元，国际合作项目的123万元。
目前我院有在研项目18项，研究内容涵盖了我国我省的重要公共卫生问题，包括新型农村合作医疗、艾滋病防治、农药危害、烟草控制、电磁辐射、营养评价等。
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